

在利用液質聯(lián)用技術(LC-MS/MS)分析蛋白質、多肽等生物大分子時,變性(Denaturation)是一個極其關鍵的樣品前處理步驟。其核心目的是破壞生物大分子的高級結構(二、三、四級結構),使其線性展開。這對于后續(xù)的分析至關重要,原因如下:
1.暴露酶切位點:蛋白質通常需要被特定的蛋白酶(如胰蛋白酶)切割成更小的肽段才能被質譜有效分析和鑒定。天然折疊的蛋白質會隱藏其酶切位點,導致酶切效率低下甚至失敗。變性使蛋白質伸展,讓酶切位點充分暴露。
2.提高溶解度:某些蛋白質或復合物在天然狀態(tài)下溶解度差,容易聚集沉淀。變性劑有助于溶解這些難溶性組分。
3.破壞非共價相互作用:變性打斷蛋白質內部的氫鍵、疏水相互作用等,瓦解其緊密結構,為后續(xù)的還原和烷基化步驟創(chuàng)造條件。
4.滅活蛋白酶/酶:高溫或強變性劑能有效滅活樣品中可能存在的內源性蛋白酶,防止它們在后續(xù)處理中降解目標蛋白。
常用的變性條件
生物大分子LC-MS/MS檢測中常用的變性條件主要依賴于化學變性劑和熱變性:
1.強變性劑:
*尿素(Urea):常用濃度6-8M。通過破壞氫鍵網絡使蛋白質變性。優(yōu)點是價格低廉,使用廣泛。注意:高溫下(>37°C)尿素會分解產生異氰酸酯,導致蛋白質氨基甲?;ㄒ环N非酶修飾),干擾后續(xù)分析,因此通常避免高溫長時間處理。
*鹽酸胍(GuanidineHydrochloride,GuHCl):常用濃度6-8M。變性能力比尿素更強,能更有效地溶解難溶蛋白和破壞疏水核心。它同樣能抑制蛋白酶活性。相比尿素,在高溫下更穩(wěn)定,不易產生副反應。
*十二烷基硫酸鈉(SDS):陰離子去污劑,常用濃度0.1%-2%。通過破壞疏水相互作用并包裹蛋白質使其帶負電荷而變性溶解。關鍵點:SDS會嚴重干擾質譜電離和色譜分離,必須在酶切前徹底去除(通常通過沉淀、過濾或強離子交換色譜除鹽柱實現(xiàn))。
2.還原劑(輔助變性并打斷二硫鍵):
*二硫蘇糖醇(DTT)或三(2-羧乙基)膦(TCEP):常用濃度5-20mM。這些還原劑能打斷維持蛋白質高級結構的二硫鍵(-S-S-),將其還原為巰基(-SH),是變性不可或缺的搭檔。通常在變性劑存在下加入。
3.熱變性:
*將樣品在含有變性劑/還原劑的緩沖液中加熱(通常90-100°C,5-15分鐘),能更快速、徹底地破壞蛋白質結構,尤其對結構穩(wěn)定的蛋白質有效。使用鹽酸胍時更常結合高溫處理。
典型流程順序:通常先加入變性劑和還原劑(常結合熱變性)使蛋白質完全變性、還原(打斷二硫鍵),然后進行烷基化(常用碘乙酰胺IAA或碘乙酸IAM,濃度10-50mM,室溫避光反應20-30分鐘),將暴露的巰基(-SH)烷基化封閉,防止其重新形成二硫鍵。最后,在酶切前可能需要稀釋或更換緩沖液(特別是使用尿素時,需降低濃度至<2M以下,因為高濃度尿素會抑制胰蛋白酶活性)。
廣州中森檢測的蛋白解離方法
廣州中森檢測作為專業(yè)的第三方檢測機構,其蛋白質組學或靶向蛋白質分析服務中采用的蛋白解離(通常指包含變性、還原、烷基化的完整前處理流程)方法,會嚴格遵循科學規(guī)范和項目需求。雖然具體內部優(yōu)化流程可能不公開,但可以預期他們會采用行業(yè)廣泛接受的標準方法,核心步驟通常包括:
1.裂解:使用含有強變性劑(如8M尿素或6M鹽酸胍)和還原劑(如5-10mMDTT或TCEP)的裂解緩沖液處理樣品(細胞、組織等),充分裂解細胞、溶解蛋白并變性還原。此步驟常結合超聲破碎(助溶)和加熱(如95°C,5-10分鐘)。
2.烷基化:在還原后加入烷基化試劑(如20-50mMIAA),室溫避光反應以封閉巰基。
3.緩沖液置換/稀釋:尤其在使用尿素時,會通過稀釋、超濾或緩沖液置換(例如使用除鹽柱)將溶液環(huán)境調整到適合后續(xù)酶切的條件(如降低尿素濃度至<2M,或換成Tris-HCl等緩沖液,pH~8.0)。
4.酶切:加入胰蛋白酶(或其他蛋白酶),在適宜溫度(通常37°C)下進行過夜酶解,將蛋白質切割成肽段混合物。
總結:變性是LC-MS/MS蛋白質分析成功的基礎。通過合理使用變性劑(尿素/鹽酸胍/SDS)、還原劑(DTT/TCEP)和熱處理的組合,并配合嚴謹?shù)倪€原、烷基化流程,才能確保蛋白質被充分解離、酶切,最終獲得高質量的質譜數(shù)據(jù)用于定性和定量分析。廣州中森檢測等專業(yè)機構會依據(jù)樣品類型和檢測目標,優(yōu)化并執(zhí)行這些關鍵的前處理步驟。
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